「以前のバージョンを削除」しない方法。概ねこちらに書かれている内容で問題なし。
ただしいくつか細かい部分を補足。
1)「すべてアップデート」を選択しない
「すべてをアップデート」をクリックすると、デフォルト設定で一気にアップデートされる可能性があるので、面倒ですがアプリ別に「アップデート」ボタンをクリックするのが安全。
「アップデート」ボタンをクリックすると[詳細オプション」が設定できるダイアログが表示されます。
2) 詳細オプションの内容を表示する
「詳細オプション」の設定ができるダイアログが表示されますが、「詳細オプション」の内容はFolded状態で見えません。ここでそのまま「アップデート」をクリックすると古いバージョンは上書きされて消えてしまいます。
一息入れて「詳細オプション」部分をクリック。
3) 詳細オプションを設定する
「詳細オプション」の設定項目は「以前の設定および環境設定を読み込む」「以前のバージョンを削除」の2項目。
「以前のバージョンを削除」のCheckを外します。
この2項目ぐらいならFoldしなくても良い気もしますが、色々理由があるのかもしれません・・・
4) 「以前のバージョンを削除」をオフにして「アップデート」
「以前のバージョンを削除」OFFの状態で「アップデート」をクリックしてアップデートを実行します。
万が一、エラーでアップデート失敗し、再度アップデート手続きする場合は「詳細オプション」を再設定。
たしか過去設定は残らず、デフォルト設定（つまり「以前のバージョンを削除」がON）になっていたはずです。
面倒ですけど、再度「詳細オプション」を確認＋設定するのが安全です。